闡述pcr核酸檢測(cè)試劑盒建立的理論模式和工作原理
1、什么是定量PCR?
以參照物為標(biāo)準(zhǔn),對(duì)PCR終產(chǎn)物進(jìn)行分析或?qū)CR過(guò)程進(jìn)行監(jiān)測(cè),從而達(dá)到評(píng)估樣本中靶基因的拷貝數(shù),稱(chēng)為定量PCR。定量PCR的可行性定量一般是在PCR擴(kuò)增的指數(shù)期進(jìn)行的。
2、定量PCR定量的理論依據(jù)是什么?
特定的待擴(kuò)增基因片段起始含量越大,則指數(shù)擴(kuò)增過(guò)程越短,當(dāng)擴(kuò)增速率趨于穩(wěn)定后,則無(wú)論原來(lái)樣品中起始模板含量多少,終擴(kuò)增片段的含量通常是一樣的。
理想的擴(kuò)增結(jié)果:Y=X×2n其中Y代表擴(kuò)增產(chǎn)物量,X代表PCR反應(yīng)體中的原始模板數(shù)n為擴(kuò)增次數(shù);理論上PCR擴(kuò)增效率為*,PCR產(chǎn)物隨著循環(huán)的進(jìn)行成指數(shù)增長(zhǎng),但實(shí)際上:DNA的每一次復(fù)制都不*,即每一次擴(kuò)增中,模板不是呈2的倍增長(zhǎng);實(shí)際應(yīng)為:Y=X(1+E)n,其中E代表擴(kuò)增效率:E=參與復(fù)制的模板/總模板,通常E≤1,E在整個(gè)PCR擴(kuò)增過(guò)程中不是固定不變的。通常X在1~105拷貝、循環(huán)次數(shù)n≤30時(shí),E相對(duì)穩(wěn)定,原始模板以相對(duì)固定的指數(shù)形式增加,適合定量分析,這也就是所謂的指數(shù)期;隨著循環(huán)次數(shù)n的增加(>30次),E值逐漸減少,Y呈非固定的指數(shù)形式增加,后進(jìn)入平臺(tái)期。
3、熒光定量PCR定量的理論模式又是什么?
PCR是對(duì)原始待測(cè)模板核酸的一個(gè)擴(kuò)增過(guò)程,任何干擾PCR指數(shù)擴(kuò)增的因素都會(huì)影響擴(kuò)增產(chǎn)物的量,使得PCR擴(kuò)增終產(chǎn)物的數(shù)量與原始模板數(shù)量之間沒(méi)有一個(gè)固定的比例關(guān)系,通過(guò)檢測(cè)擴(kuò)增終產(chǎn)物很難對(duì)原始模板進(jìn)行準(zhǔn)確定量。近年來(lái)研究人員通過(guò)大量的實(shí)踐,研究了相對(duì)準(zhǔn)確的定量PCR方法,即熒光定量PCR。
PCR擴(kuò)增通式:①Tn=T0(1+E)n
②Tn=Tn-1(1+E)n注:[0
其中E表示擴(kuò)增效率,n為循環(huán)數(shù),Tn表示在n個(gè)周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量,Tn-1表示在n-1個(gè)周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量,T0為原始模板數(shù)量。設(shè)定PCR到達(dá)指數(shù)擴(kuò)增期時(shí),產(chǎn)生一定的熒光(熒光依賴(lài)于某一循環(huán)擴(kuò)增產(chǎn)物的總量,即特定的拷貝數(shù)K,為常數(shù),大約在1010左右)高于背景為儀器所識(shí)別,此時(shí)的循環(huán)數(shù)為CP(crossingpoint),也就是K=T0(1+E)CP,取對(duì)數(shù)即:
lgK=lgT0+CP*lg(1+E)
CP=-1/lg(1+E)*lgT0+lgk/lg(1+E)
pcr核酸檢測(cè)試劑盒的成分產(chǎn)品組成:DNA提取液2、CTPCR反應(yīng)液、HS-Taqplus酶、UNG、CT陰性對(duì)照、CT臨界陽(yáng)性對(duì)照、CT強(qiáng)陽(yáng)性對(duì)照。產(chǎn)品有效期:貯存于-20℃,有效期12個(gè)月。附件:注冊(cè)產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn),產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)。
適應(yīng)癥該產(chǎn)品用于對(duì)人尿道、生zhi道分泌物拭子樣本中的沙眼衣原體核酸DNA的檢測(cè)
PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對(duì)引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收;剛開(kāi)始時(shí),探針結(jié)合在DNA任意一條單鏈上;PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’端-3’端外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)可接收到熒光信號(hào),即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成*同步。
pcr核酸檢測(cè)試劑盒的檢驗(yàn)原理:pcr核酸檢測(cè)試劑盒從人血清或血漿中提取丙型肝炎病毒核酸(HCVRNA),通過(guò)RT-PCR一步法反應(yīng),利用特異性引物對(duì)HCVRNA進(jìn)行體外擴(kuò)增,在體系中采用Taqman-MGB探針?lè)ú⒔Y(jié)合非競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)標(biāo)技術(shù)來(lái)定量檢測(cè)人血清或血漿中丙型肝炎病毒核酸(HCVRNA)的數(shù)量。可用于臨床對(duì)丙型肝炎的輔助診斷和抗病毒yao物的療效觀察。